Nascido em Novo Hamburgo, em uma família que respira esporte, Fernando Roese iniciou seus primeiros passos no tênis aos oito anos de idade, inspirado pelo pai Pedro, que teve destaque no cenário gaúcho. Em 1981 conseguiu expressivas vitórias no circuito juvenil, foi vice-campeão brasileiro, na categoria 16 anos, campeão do Banana Bowl (em simples, duplas e por equipes), vice-campeão do Orange Bowl, vice-campeão no Masters da Copa Hering e semifinalista do torneio Rolex de Nova York.
Também em 1981, com apenas 15 anos de idade, jogou seu primeiro torneio profissional, chegando à semifinal do Masters do I Circuito Satélite Melitta, perdendo para o campeão Júlio Góes.. Ele seguiu no circuito até 1996, quando pendurou a raquete. É o segundo brasileiro mais jovem a vencer um jogo de ATP, conseguindo o feito com apenas 17 anos e 3 meses, atrás apenas de Marcelo Saliola (16 anos e 10 meses).
Top 100 em simples e duplas, Roese chegou a ser o 92º do mundo em simples e o 81º nas duplas. Seu saque foi considerado o mais forte entre os jogadores brasileiros e seu estilo de jogo marcado pelos voleios e pela facilidade com que sobe à rede. Disputou os quatro Grand Slam nas duas modalidades e teve como melhor campanha a segunda rodada de duplas em Wimbledon 1989 e no US Open de 1990 e 1991.
Tendo enfrentado rivais de peso como os norte-americanos John McEnroe e Michael Chang, o gaúcho teve como melhor resultado em nível ATP o vice-campeonato no Guarujá, em 1991. Além disso, ele conquistou dois títulos de challengers e três vices em simples. Nas duplas, foi campeão do ATP de Itaparica com Mauro Menezes, e vice com o espanhol Juan Avendano em Bastad (1984) e com Nelson Aerts no Rio de Janeiro (1990).
Entre 1982 e 1996 representou o Brasil por treze vezes na Copa Davis, obtendo um retrospecto de seis vitórias e nove derrotas. Em 1992, ajudou o país a chegar à semifinal, na melhor campanha da história da competição, formando a dupla com Cássio Motta, que derrotou a Alemanha de Boris Becker e a Itália. Conquistou a medalha de ouro em simples e a medalha de bronze nas duplas mistas, com Gisele Miró, nos Jogos Pan-Americanos de 1987 em Indianápolis.
Após encerrar a carreira de tenista, tornou-se treinador, integrou o Instituto Gaúcho de Tênis (IGT), trabalhou na Daher Tennis, em São José dos Campos, e foi o capitão da equipe brasileira da Billie Jean King Cup entre 2016 e 2018. Treinou nomes como André Sá, Ricardo Mello, Flávio Saretta, Bruno Soares, André Ghem e Gabriela Cé e atualmente é também comentarista.